Op 23 mei 2008 werd het nieuwe Cultureel-erfgoeddecreet goedgekeurd. Dit decreet legt sterk de nadruk op een complementair beleid tussen steden, gemeenten en provincies. De indeling van erkende musea bij het Vlaamse, regionale of lokale niveau geeft aan van welk bestuursniveau er verwacht wordt dat het structurele verantwoordelijkheid opneemt. 58 musea zijn door de Vlaamse overheid erkend.

Op vrijdag 24 oktober 2008 nam de Vlaamse Regering, op voorstel van Vlaams minister Bert Anciaux, de beslissing om de erkende musea in te delen bij het lokale, regionale of Vlaamse niveau.

Musea ingedeeld bij het lokale niveau
De musea die worden ingedeeld bij het lokale niveau, ontvangen als overgangsbepaling een werkingssubsidie van 12.500 euro tot en met 2014.

* De Kolonie, Lommel
* Stedelijke Musea Lier
* Museum George Grard, Gijverinkhove
* Karrenmuseum, Essen
* Stedelijke Musea Dendermonde
* Jakob Smitsmuseum, Mol
* Stedelijk Museum Lokeren
* Stedelijk Modemuseum, Hasselt
* Stadsmus, Hasselt
* Nationaal Wielermuseum, Roeselare
* Stedelijke Izegemse Musea
* Talbot House, Poperinge
* Hopmuseum, Poperinge

Musea ingedeeld bij het regionale niveau
De ondersteuning van de regionale musea maakt deel uit van het provinciale cultureel-erfgoedbeleid. Ter versterking van dat beleid geeft de Vlaamse Regering op basis van het Cultureel-erfgoeddecreet een werkingssubsidie aan de provincies. De wijze waarop deze middelen ten behoeve van de regionale musea ingezet worden, wordt in overleg met de provincies binnen een cultureel-erfgoedconvenant vastgelegd.

* Speelgoedmuseum, Mechelen
* Stedelijke Musea Mechelen
* Provinciaal Diamantmuseum, Antwerpen
* Samenwerkingsverband TRAM 41, Turnhout
* M, Leuven
* Museum voor Oudere Technieken, Grimbergen
* Erfgoedsite Tienen, Tienen
* Museum Felix De Boeck, Drogenbos
* Museum Vlaamse Minderbroeders, Sint-Truiden
* Samenwerkingsverband Maaseiker Musea, Maaseik
* Nationaal Jenevermuseum, Hasselt
* Museum van Deinze en de Leiestreek, Deinze
* Roger Raveelmuseum, Zulte
* Provinciaal Archeologisch Museum, Velzeke/Ename
* Museum Dhondt-Dhaenens, Deurle
* De Wereld van Kina, Gent
* Nationaal Vlas-, Kant- en Linnenmuseum, Kortrijk
* Broelmuseum, Kortrijk
* Bakkerijmuseum “Walter Plaetinck” – Zuidgasthuishoeve, Veurne
* Ten Duinen 1138, Koksijde
* Memorial Museum Passchendaele 1917, Zonnebeke

Musea ingedeeld bij het Vlaamse niveau
Aan de musea ingedeeld bij het Vlaamse niveau kent de Vlaamse Regering een jaarlijkse werkingssubsidie toe voor de beleidsperiode 2009-2013. Met elk museum ingedeeld bij het Vlaamse niveau wordt een beheersovereenkomst afgesloten. De werkingssubsidie bevat de financiële middelen voor de uitvoering van deze beheersovereenkomst, en bedraagt per museum ten minste 200.000 euro per jaar.
De beheersovereenkomst bepaalt de opdracht die de Vlaamse Gemeenschap geeft aan het museum voor het ter beschikking stellen van hun expertise aan de cultureel-erfgoedgemeenschap en welke aspecten van de werking prioritair versterkt dienen te worden. Eveneens wordt de toegang voor min 26-jarigen voor maximaal 1 euro opgenomen. Daarnaast zullen deze musea via de beheersovereenkomst worden aangestuurd om de beleidslijnen m.b.t. cultuureducatie en interculturaliteit op te nemen.

* Museum voor Schone Kunsten, Gent - 755.000 euro
* In Flanders Fields Museum, Ieper - 610.000 euro
* Openluchtmuseum Bokrijk, Genk - 600.000 euro
* Groeningemuseum, Brugge - 510.000 euro
* S.M.A.K., Gent - 510.000 euro
* Museum Dr. Guislain, Gent - 480.000 euro
* Openluchtmuseum voor Beeldhouwkunst Middelheim, Antwerpen - 400.000 euro
* Samenwerkingsverband Kunstmusea Antwerpen, Antwerpen - 400.000 euro
* Museum Plantin-Moretus, Antwerpen - 380.000 euro
* Provinciaal Gallo-Romeins Museum, Tongeren - 370.000 euro
* Museum voor Industriële Archeologie en Textiel, Gent - 358.000 euro
* Samenwerkingsverband Provinciaal Museum voor Moderne Kunst en Provinciaal Museum Constant Permeke, Oostende/ Jabbeke - 350.000 euro
* Designmuseum, Gent - 300.000 euro
* Huis van Alijn, Gent - 300.000 euro
* Sportmuseum Vlaanderen, Hofstade - 300.000 euro
* Provinciaal Zilvermuseum Sterckshof, Antwerpen - 287.000 euro
* Modemuseum Antwerpen - 280.000 euro
* FotoMuseum, Antwerpen - 240.000 euro
* Hospitaalmuseum, Brugge - 233.000 euro

In totaal maakt de Vlaamse overheid 8.965.500 euro vrij voor de structurele ondersteuning van de erkende musea.

Bron: Kunsten en Erfgoedf