De museumcollectie werd jarenlang tentoongesteld op de zolderverdieping van het gemeentehuis van Drogenbos. Vanaf 1995 werd de zeer omvangrijke collectie, die Felix De Boeck aan de gemeenschap schonk, bewaard en tentoongesteld in een nieuw museum. Tien jaar later kende het museum een metamorfose. Het evolueerde van een monografisch naar een thematisch museum waar Felix De Boeck het vertrekpunt is geworden voor steeds wisselende tentoonstellingen en projecten rond zowel historische als hedendaagse avant-gardekunst.

Met steun van de provincie Vlaams-Brabant werden in 2011 de depotruimtes van het museum gecentraliseerd, heringericht en aangevuld met een polyvalente depotruimte voor conditie- en toestandscontrole van tweedimensionale erfgoedobjecten en kleine driedimensionale objecten. Ook erfgoedbeheerders uit de regio kunnen na afspraak van deze infrastructuur én van de expertise van de museummedewerkers gebruikmaken.